La preside Griffin dona alle Winx un rubino magico in grado di segnalare la posizione delle Trix e le divide in coppie, ma le ragazze fanno fatica ad andare d'accordo. Nel frattempo Griffin entra nel cuore di Torrenuvola per rientrare in possesso della struttura attraverso una meditazione. Tecna, in coppia con Bloom, riesce a unire il rubino a un congegno magico in suo possesso, con il quale intende localizzare le Trix che intanto hanno già aggredito e neutralizzato Mirta, Lucy, Musa e Stella. Mentre Flora e Aisha tentennano in balia della paura degli strani movimenti della torre stregata, Bloom e Tecna vengono anticipate dalle Trix che irrompono nella stanza dove si trovano. Le Winx vengono salvate solo dall'intervento di Griffin che imprigiona le streghe dopo aver ripreso il controllo di Torrenuvola. Ma il vantaggio dura poco: le Trix fanno sprofondare nel caos la magia intrinseca nella torre, che comincia a rivoltarsi contro tutto e tutti. Le Winx tentano una convergenza per fermarle che però non va a buon fine, rivoltandosi contro di loro. Tristi e debilitate tornano quindi ad Alfea, mentre le Trix entrano in possesso del Codice.
